大陆居民往来台湾通行证G签注和入台证都是去往台湾旅游所需的证件，但是在发放单位等方面是不同的，区别为：

1、办理地点不同。大陆居民往来台湾通行证G签注是在户籍所在地出入境管理处办理的个人旅游签注；而入台证是台湾当局内政部移民署办理的。

2、受理区域不同。大陆居民往来台湾通行证的受理是在全国任一出入境办理处；而受理台湾地区自由行入台证的城市有北京、上海、厦门、天津、杭州、广州、南京、济南、重庆、西安、深圳、福州、沈阳、郑州、武汉、苏州、宁波、青岛、石家庄、长春、合肥、长沙、南宁、昆明、成都和泉州等城市户口的居民。

3、使用期限不同。大陆居民往来台湾通行证G签证的有效期为六个月；而入台证的有效期为为三个月，可以停留最多十五天，但只可以出入境一次，之后要再重新在网上申请。

4、证件分类不同。大陆居民往来台湾通行证G签注在有效期内单次使用的，而入台证分单次证、逐次证、一年多次证、三年多次证之分。 来源：——大陆居民往来台湾通行证 来源：——入台证

因公赴台通行证办理流程是怎样的？

办台湾签证需要：1、办理台湾通行证。本人前往户籍所在地公安分局出入境科办理，需要照片（蓝底两寸有回执）＼户口本原件、复印件身份证原件、复印件＼台湾方面的公务邀请函。（如果您是政府等公务人员，还需要省市级台办的批准）。 2、办理入台证。办理好通行证后，应该由台湾方邀请单位代办入台证。台湾方面提供的表格、白底照片（大致为两寸，头部大小长度不小于35MM）、身份证复印件等。 3、回寄入台证。台湾方将办好的入台证寄给您，大陆公民在机场办理登机手续时没有入台证是不予办理登机的，进入台湾海关时没有入台证也无法进入台湾。所需材料： 申请前往台湾进行经贸活动和科技、文化、教育、体育、学术、卫生、新闻等各项交流，以及参观、访问、考察、采访、举办展览会等。需提供以下材料： （1）交验户口簿、身份证（核对原件、收复印件）。户口簿和身份证上姓名、出生日期应与台湾地区旅行证上的姓名、出生日期一致。现役军人须先办理临时身份证。 （2）提交国务院台湾事务办公室批件。（领队附原件，其他人收复印件，每人一份）。 （3）提交申请人人事档案单位公函（公函须写明申请人何时何因赴台，是否同意。申请人系中央级机关、企事业单位的一般工作人员，由司局级党委或人事部门或保卫部门出具意见；申请人系市级机关、企事业单位的一般工作人员，由县团级党委或人事部门或保卫部门出具意见；申请人系单位领导干部，由其组织人事部门按干部管理权限由上级主管部门出具意见。每人一函。同一单位同一团内有2 人以上的可开一份公函，但说明每个人的姓名。一人交公函原件，其他人交公函复印件。 （4）台湾地区旅行证复印件。 （5）提交填写完整的因公赴台申请表。 （6）提交三张二寸照片（一张贴在因公赴台申请表上，其他二张背后写上申请人姓名随表交上）。 （7）所有复印件均须使用B5大小纸张，具体规格与申请表相同。 （8）申请人已持有赴台证件的，申请时须将原证件交回。 领取证件： （1）出境证件应由申请人领取，先交费，后取证。 （2）领取证件时提交“回执”和“证件费收据”出示申请人的户口簿或居民身份证。 （3）需申办单位工作人员取证的，需持单位介绍信（注明赴台人员姓名和工作人员姓名）出示取证人身份证件。 （4）领取证件后请仔细核对，如有疑问，请立即向工作人员询问。