港澳通行证和台湾通行证不一样。
港澳通行证，俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。
《大陆居民往来台湾通行证》，是中国大陆地区居民往来中国台湾地区所持有的证件，一般与《入台证》一起检查。从2015年7月1日起《大陆居民往来台湾通行证》的有效期由原来的五年改为10年。



扩展资料
港澳通行证证件有效期：往来港澳通行证有效期5年。2014年9月15日，全面启用电子往来港澳通行证规定，成年人电子往来港澳通行证有效期延长为10年，对未满16周岁的仍签发5年有效通行证。现用的本式往来港澳通行证将于2019年9月13日全部失效。
台湾通行证收费标准：
1，《大陆居民往来台湾通行证》每证80元；
2，大陆居民往来台湾一次有效签注，每件15元；多次有效签注，每件80元。
参考资料来源：百度百科-大陆居民往来台湾通行证
参考资料来源：百度百科-中华人民共和国往来港澳通行证

《大陆居民往来台湾通行证》签注问题

五、证件的补发、换发
（一）证件补发
1、持证人出境前遗失证件，向原受理申请的直辖市、地（市）级公安机关出入境管理部门提出申请，经核实后审批补发给《往来台湾通行证》及相应的前往台湾签注。因特殊情况持证人来不及返回原发证地的，应向原受理申请的公安机关申明原因，由原审批发证的省、自治区、直辖市公安厅、局出入境管理部门委托申请人所在地的同级公安机关出入境管理部门代为补发证件及签注。
2、持证人在境外遗失证件，可通过民间机构或者委托其大陆亲属，向公安部出入境管理局或原受理申请的公安机关出入境管理部门提出申请，并提交拟入境的具体时间、所乘交通工具的班（次）及入境口岸。经核实后，由公安部出入境管理局通知申请人拟入境口岸所在地的公安机关出入境管理部门签发给一次入出境有效的《中华人民共和国入出境通行证》，并通知拟入境口岸的边防检查机关准予入境。入境后由原受理申请的公安机关出入境管理部门补发给证件及签注。
3、公安机关出入境管理部门补发证件的同时，应当将大陆居民遗失《往来台湾通行证》的有关资料报公安部出入境管理局。
（二）证件换发
1、持证人有下列情形之一的，可以申请换发证件：
（1）证件有效期不足6个月或所申请签注有效期超过证件有效期的；
（2）证件内页用完；
（3）证件损毁。
2、申请补发、换发证件，须提交下列有关证明：
（1）补发证件的，提交证件报失地警察机关出具的证明；
（2）换发证件的，提交原持有的《往来台湾通行证》。证件损毁的，提交证件损毁说明书。
3、公安机关出入境管理部门受理申请后，应收回原证件。经核实后审批换发《往来台湾通行证》，签发前往台湾签注。被收回的证件，应登记销毁，并报省、自治区、直辖市公安厅出入境管理部门备案。