娄底港澳通行证不可以在耒阳签注，港澳通行证签注只能在户籍所在地县级公安局出入境管理局申请办理。根据《中华人民共和国往来港澳通行证、签注审批签发管理工作规范》
一、受理工作
（一）受理部门
内地居民申请往来港澳通行证和签注，须由其常住户口所在地公安机关出入境管理部门受理，但下列情形除外：
1、内地居民申请赴香港或者澳门商务，须由其工作单位所在地公安机关出入境管理部门受理。

2、内地居民通过劳务经营公司申请赴香港或者澳门就业，须由劳务经营公司所在地地级以上（含地级，下同）公安机关出入境管理部门受理。
（二）申请材料
1、填写完整并贴有申请人近期正面免冠彩色照片（48×33mm）的《内地居民往来港澳地区申请表》（以下简称申请表，式样见附件一）。

2、申请人身份证明。内地居民交验居民户口簿、居民身份证原件（申请人未满16周岁，只需交验居民户口簿；军人只需交验身份证明），并提交复印件。
3、与申请事由相应的证明材料。
4、工作单位或者公安派出所意见。