一般情况下，院与系是同一个概念，院系院系，同一个概念，专业是其下属的机构，如一系（自动化学院）自动化专业。反正我们学校原来是这样的，大的院叫院，小的叫系，现在都变成院了，没有系的概念了……

什么大学什么专业和什么大学什么系什么专业是一个道理。大学设院系部。以专业类和专业群分院系。一般二级学院有两种可能，一种是半独立性质归属本部管理的二级学院，他的专业和系也较全面，但层次是三本或者高职。三本就是挂靠和冠名。一种的是以专业群来建设院系，比如经管院下设的系有工商管理系或MBA培训和研究对外交流的部。因为专业群比较大所以设院。这种不同于前者的院，这是也相同相近专业群设立的院。

一般来讲是学校里有若干个学院，学院下面有若干个系。系这一层就已经到专业这个层次了。比如自动化系里的学生都是学自动化专业的。这个系某种程度上就代表了这个学校专业的水平

大学里的学院、系、专业之间的关系：院与系，是上、下级关系。一所大学，下辖若干个学院。每个学院下辖若干个系。每个系会开设若干个专业。