南京航空航天大学金城学院理工科专业很强，这一点继承了母校南京航空航天大学优良传统，有机械工程自动化，电气工程及自动化，交通运输（飞机维修），自动化，测控技术等专业。

文科专业相对少一些，但是会计学、会计学（CIMA方向）、金融学专业相当不错，还有一些冷门优质专业，比如管理系的工业工程专业，每年招生情况并不算好，但是就业情况非常好，都是一些大型汽车集团或者通讯生产制造型企业直接录用，而且就业待遇也非常高。