不算。

所谓的应届生，专指在应该毕业年份的高校毕业生离校时和在择业期内（国家规定择业期为二年，有些地方延长至三年）未落实工作单位，其户口、档案、组织关系保留在原毕业学校，或保留在各级毕业生就业主管部门（毕业生就业指导服务中心）、各级人才交流服务机构和各级公共就业服务机构的毕业生。显然，只要是在职，就已经落实工作单位和参加工作了。因此，不管是在职硕士毕业生，还是在职博士毕业生，也不管是中科院还是其他科研院所或高校的在职毕业生，都不能算应届毕业生。