游戏剧情有两个，左边结局和右边结局。

选项Q：认为mother说的话有一定道理。选项E：认为mother说的话是胡搅蛮缠。Q：mother说服 克莱恩 让他输入启动引爆军用核弹头的密码(游戏将完结 无法出续作，因为这个区域已经被核弹炸毁，题材已不是游戏的本质)。E：克莱恩说的话激怒的mother，被灌入了抗毒剂 而且已经闻过了深蓝色气体(序章 GRE 说过这个抗毒剂是未成型的残次品，因为苏勒曼，盗走了部分抗毒剂的重要文件)虽然mother已被克莱恩消灭，但是很不幸克莱恩变异成了僵尸。