南京工程学院附近有南京医科大学、江苏经贸职业技术学院、金陵科技学院。

1、南京医科大学：坐落于六朝古都的中国历史名城——江苏省南京市。学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院。1981年，学校被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，学校更名为南京医科大学，是江苏省属重点建设高校，教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校。

2、江苏经贸职业技术学院：隶属江苏省教育厅，是一所培养应用型、复合型、创业型技术和经营管理人才的高职院校。学院创建于1952年，2002年经省政府批准、教育部备案，江苏商业管理干部学院和江苏省商业学校合并改建为江苏经贸职业技术学院。

3、金陵科技学院：坐落于六朝古都南京，是一所以培养高级应用型人才为主的全日制普通本科院校，全国“应用技术大学（学院）联盟”首届理事单位。学校前身是1980年成立的新中国第一所职业大学——金陵职业大学和1958年成立、1984年复建的南京市农业专科学校。