吉林大学商学院在中心校区也叫前卫南区，是原吉大的校区，也是吉大基础设施最好的校区，甚至也可以说是整个东北基础设施最好的校区；管理学院在南岭校区，是原吉林工业大学的校区，隔壁是东北师范大学，基础设施上不如中心校区。

两个学院的很多专业都有重合，但是方向有所不同，商学院的稍好一些也更难考一些：商学院的偏重理论，有四个院属研究机构：吉林大学现代服务业研究院、韩亚经济与金融研究中心、现代管理研究中心和现代信息与决策研究中心。管理学院的偏重应用实践，有依托管理学院成立的吉林大学创新创业研究院，是吉林省教育厅首批吉林特色新型高校智库。