万州区过去是万县,是四川省万县地区驻地。
1992 年,撤销万县地区。设立地级万县市,下辖龙宝区、天城区、五桥区3个区和8个县。1997年,重庆成为直辖市后,撤销万县市,3个市辖区地域改设万县区,几个县由万县移民开发区管辖。1998年万县区更名为万州区。实际上,万州是过去一个独立城市的市辖区部分,变成了重庆市的一个区。万州区是渝东北、川东、鄂西、陕南、黔东、湘西的交通枢纽,重要物资集散地,成渝城市群沿江城市带区域中心城市,民国时期曾经非常繁华。如今,万州是最大的三峡移民城市,城区有100万人口。万州区在重庆市的区县中,地位比较高,GDP有1000亿左右。