提出生态移民，是因为三峡库区作为长江上游生态屏障的战略意义，及其脆弱生态的现状。
2003年以来，三峡库区水位上涨淹没土地70万亩，而可开垦的土地仅19.4万亩，后备耕地资源不足，导致土地资源紧张。而随着人口快速增长，为满足日益增长的生产生活需求，居民为增加单位面积的粮食产量，大量增施化肥农药，导致大量化肥农药进入地表水环境.农民耕作分散，生产方式落后，人们不是大力在耕作方式上求得进步，而是不顾资源再生能力，为扩大耕作面积，开荒种粮导致水土流失严重。而畜禽养殖，则成为水体有机物污染的重要来源。出于发展压力，追求粗放的经济增长及不合理的产业结构导致库区生态环境压力过大。库区有丰富的矿产资源、旅游资源和水资源，但矿产资源开发引起的生态破坏亦十分突出，表现在，地表失稳、采空区出现塌陷坑、地裂缝、危岩、崩塌等。要实现对库区的生态保护，恢复森林，养护水源，发挥其长江流域重要生态屏障的功能，必须要大量迁出库区人口。
