根据相关规定，曲阜东站的候车室是允许过夜的。

但是需要注意的是，过夜旅客需要注意安全，妥善保管好自己的行李等财物，避免发生意外。同时，为了保持公共秩序，需要遵守车站相关规定，保持安静，不要影响他人休息。最后，还要关注列车时间，避免错过乘车时间。总之，过夜只是在特殊情况下的临时解决方案，应该尽量避免。