东北师范大学净月校区和本部只是学院设置不同，二者都属于东北师范大学。

一、东北师范大学本部的学院有：教育学部、经济学院、商学院、文学院、历史文化学院、外国语学院、美术学院、数学与统计学院、信息与软件工程学院、物理学院、化学学院、生命科学学院、地理科学学院、体育学院、传媒科学学院、马克思主义学部、留学生教育学院。

二、东北师范大学净月校区的学院有：政法学院、工商管理学院、信息传播与管理学院、广播电视学院、职业技术教育学院、对外经贸学院、计算机科学与技术学院、环境学院、外语学院、音乐学院、美术学院、留日预校。