南京妇幼保健院的自费转医保，需要按照以下步骤进行：先准备好相关材料，包括医保卡、身份证、就诊记录等。

到医院的财务科或当地医保部门进行咨询，了解自费转医保的具体流程和要求。根据要求填写相关表格，并提交所需材料。等待审核，一旦审核通过，您就可以按照医保政策享受相应的医疗待遇了。需要注意的是，不同地区的医保政策可能有所不同，具体要求和流程可能会有所差异。建议您在办理之前先咨询当地医保部门或医院的财务科，了解详细情况。