菲律宾四面环水，拥有发达的港口系统。

菲律宾公共港口均归菲律宾政府所有，管理当局为菲律宾港务局(PPA)。该国的未来几年规划连通各个港口之间的交通，重点是公路和铁路与周边地区港口的连接。菲律宾的主要港口主要包括马尼拉港（manila）、宿雾港(cebu)、八打雁港(batangas)、苏比克港(subic bay)、卡加延德奥罗港(Cagayan de Oro)、达沃港(davao)、伊洛伊洛港(Iloilo)、桑托斯将军港(General Santos)、三宝颜港(Zamboanga)等。