随着二战期间，德国的重水工厂被摧毁，严重打击了柏林的核试验计划。

再有柏林科学家的“消极”和不配合，使得柏林的“原子弹梦”破灭了。然而，除了柏林进行原子能试验外，协约国之一的日本也很早就已经着手开始原子能的探究工作了。他们给这项计划取名为“二号研究”。一、岛国为实现大东亚共荣”的野心，研制“超级炸弹”。早在二战爆发前，东京的科学家就成功的进行过人工轰击原子核的实验，这在当时是严格保密的，而且都不相信一个岛国能够有这么大科学能力。因此，他们的核试验几乎无人知晓。直到二战爆发后，日军为了得到这种威力巨大的武器，不惜拨出5000万日元巨款建立核能研究所，妄想依靠“超级武器”加快侵略其他国家，实现所谓“大东亚共荣”的野心。1940年底，东京得知美国也在进行核计划后，让他们感到十分的惊恐。因为美国的经济实力很强，投入的经费一定充足，研制进度也一定很快。但是他们因为侵华战争的庞大的军费支出，投入研制的经费越来越少，严重地影响了研制“超级炸弹”的进展程度。作为一个资源极其匮乏的岛国，他们最大的困难就是缺乏核能材料——铀，他们首先想到了盟友德国。

二、德方爽快答应的背后原因。对于盟友的要求，德方显得十分大方，很痛快地答应立刻给予援助，并派出潜艇秘密运输。柏林当局如此痛快地答应他们，无非是基于以下几点：

1. 根据当时的国际局势来看，德美两国的决裂不可避免，为了抑制美国人的核计划，有必要首先在轴心国内确立核震慑；2.一旦美国首先研制出来，那么对柏林必将是极大的威胁，如果东京在这方面捷足先登，无疑是对美苏的威胁和牵制，减缓对德的压力；3.柏林科学家的“不争气”和同盟国密切关注他们的试验动向，一有动静，就被摧毁，没有再深入探究的环境。于是不仅答应，更积极地协助东京开展核能试验，提供核原料——铀。

三、截获情报，盟军彻底打消合作计划。在一个伸手不见五指的夜晚，一艘装载着核原料的德军潜艇悄悄地出航了。同时，日方也在接到德国方面发出的密电后，积极地做好接应工作。当然，这一切早被已破解德军密码的盟军截获，盟军立刻采取行动，要彻底打消日德之间的合作计划。根据情报，美国海军在德军潜艇必经之路，布下了天罗地网，静候他们的到来。这天上午9点30分左右，德军潜艇进入了埋伏圈，尽管采取了一系列的隐蔽措施，无线电静默，人员不得大声喧哗、保持低速前进，不发出声音。但动力系统是无法关闭的，美国海军的声纳兵还是准确的测出了他们的方位。很快，德军潜艇在一枚枚深水炸弹袭击中沉入海底，一同沉入海底的还有珍贵的铀原料。后记德国的援助计划流产了，无可之下，日本军方只好在中国和蒙古等地搜刮少量的资源。然而，对于一个庞大的核计划显然是杯水车薪，核计划开展的很慢。直到1945年，美国空军开始对东京进行轰炸，在美军持续的大规模的轰炸中，“二号研究”所陷入火海中，研究资料被化为灰烬。