1、自助终端机查询为方便持证人掌握签注的使用情况，内地公安机关出入境管理部门在出境大厅安装了自助查询终端机。
持用电子往来港澳通行证的旅客只需将证件置于终端平台上，即可方便快捷地详细掌握自己的签注使用情况和签注剩余次数，并可为持证人打印提示条。
2、口岸自助咨询台港澳地区主管部门将在其总部及部分口岸（主要是海港码头口岸）设置自助咨询台，为持证人本人提供查询签注信息服务。相关资料通过计算机屏幕供持证人阅读，不提供打印的提示条。
3、出入境管理部门查询可通过在各省市的出入境管理部门，携带通行证向大厅工作人员查询。
4、微信电子查询在某些省份是可以通过关注该省市出入境微信公众号查询的。例如广东居民可在微信卡包-电子港澳通行证中即可查看港澳签注剩余次数，避免用户忘记签注已经用完的情况发生。
