农校职业技术学院设有农业技术系、园林工程系、经济管理系、食品化工系、畜牧兽医系、基础部等6个教学系(部)。

形成了农技类、园艺类、财务会计类、经济管理类、信息技术类、畜牧兽医类、食品类和化工类等8个专业群。设有作物生产技术、种子生产与经营、生物技术及应用、园艺技术、园林技术、园林工程技术、设施农业技术、会计电算化、财务管理、经济管理、物流管理、营销与策划、计算机应用技术、计算机网络技术、畜牧兽医、动物防疫与检疫、食品营养与检测、食品生物技术、农产品质量检测、应用化工技术、工业分析与检测、有机化工生产、生物制药技术、精细化学品生产技术等24个专业。