五年三年后还能申请办理护照。

但是你被遣返的日本将你列入黑名单，5年内不得入境该国。护照法规定，申请人因非法出境、非法居留、非法就业被遣返回国的，因弄虚作假，骗取护照、旅行证、出入境通行证的，或因妨害国（边）境管理受到刑事处罚的，3年以内不得申请护照、旅行证、出入境通行证。