不可以备案制开医馆。

因为民间中医医师资格证是由民间中医组织发放的，没有得到国家承认和资格认证，不具备开办医馆的资格。同时，开设医馆需要符合国家相关法律法规的规定，民间中医医师资格证不具备相关执业许可证，不能开办医院、诊所等卫生机构。虽然民间中医医师资格证不能直接开办医馆，但是可以在合法医疗机构中进行中医诊疗工作，也可以在社区服务中心、健康馆等职业场所开展中医服务。此外，民间中医医师可以向政府有关部门申请开展中医诊疗活动，如设立中医诊所、参与医疗救助等。