马尼拉过境签办理方法如下：办理菲律宾过境签，申请材料详见大使馆官方网站，一般需要特殊准备的材料包括：

1. 打印并填写两份签证申请表；2.确认的前往别国的机票和赴该国的有效签证；3.经济能力证明。

2. 送签申请者必须亲自到使领馆提交申请，或通过经认可的代理机构办理。

3. 取签办理和签发签证不超过三个工作日。