顶尖985和中流985主要区别是在综合实力上。

第一批入选的985高校是当时国内顶尖的包括北大，清华，上海交大，复旦，浙大，南京大学等9所大学，其综合实力在当时被公认为最强，主要体现在学科比较齐全，文理工医布局全面，在后来的学校评估中A类学科数量多。后来陆续又批准了几批，但综合实力与第一批比还是有一些差距，多数为行业特色比较明显，在一些学科特色明显，如电子科大，中国海洋大学，华东师大等，A类学科数量数量明显减少了。