反派身份和结局不同。

反派的身份不同，原版的恩维他们都是活体炼成的产物，以贤者之石为生，因此给人感觉会更黑暗和压抑，本身就代表着死亡。而FA反派都是从小黑瓶体内剥离出来的一部分，两个版本的结局也不同，原版版爱德华和他爸到了另一个世界，也可以理解为在原有世界里死亡，而FA版是he，访问他国学习炼丹术，弟弟艾尔也复活了。