其前身是高级军官学校，于1810年创建于柏林、是世界上第一所培养高级参谋人员的学校。

该院隶属于国防部，院长为少将，在联邦国防军副总监察长领导下进行工作。院下设有院务部，训练、理论与研究部，学员部等。此外还有院长办公室和一个咨询机构。学院共有教职员工570人，每年平均培训学员约2000人。 学院原址在巴特 埃姆斯，1958年迁至汉堡。1972年，联邦德国对军队训练进行改革，根据同类院校合并的原则，将参谋学院和国防学院并入联邦国防指挥学院，从而成了联邦德国一所综合性的高等军事学府。