一、日本有3个入国管理局。

分别为： （1）日本国驻上海总领事馆（2）日本国驻广州总领事馆二者的区别在于管辖地区的不同，具体可点击以下链接进行查看： 二者共同的作用就是审核签证申请材料，下发签证。不过需要注意的是： 留学类签证不是由这2个领馆直接发签的，而是由他们在各地派遣机构负责接收材料，然后再统一递交至日本入管局进行审核。 所以大家在申请留学签证时，要注意自己材料的送达和接收情况，以免出现遗漏或误送。除了以上2个总领事馆外，还有多个领事馆分布在各大城市。比如在北京就有日本驻天津领事馆、日本驻沈阳领事馆等。由于这些分领区的领事馆管辖区域较小，所以并没有专门负责签证申请的部门，需要申请人根据所赴目的自行选择对应的领区办理手续。

三、日本使馆和日本领事馆的区别首先，日本国大使馆是代表日本国政府，在外国设置的最高外交机构。主要职责如下：

①与有关国家的政府间进行联系；②管理居住在外国的日本人；③处理日本国政府和当地人民关系。而日本领事馆则没有上述权限，主要负责签证业务及其他领事事务，如护照颁发、延期及注销，公证认证，领事认定等相关事宜。