南京理工大学没有医学系。

南京理工大学是一所以工为主，理、工、文、经、法、教、艺等多学科协调发展的全国重点大学，其主要学科包括机械工程、光学工程、材料科学与工程、电子科学与技术、计算机科学与技术、控制科学与工程、兵器科学与技术等。如果你对医学专业感兴趣，可以考虑其他高校，如南京医科大学、东南大学医学院等。