主角是漩涡鸣人火之国木叶隐村的忍者，四代目火影波风水门和漩涡玖辛奈之子，六道仙人次子阿修罗转世。

刚出生时父母为保护村子而牺牲，并将尾兽“九尾”封印在鸣人体内。成为孤儿的鸣人从小被村民歧视，但在唯一认同他的老师海野伊鲁卡以及三代目火影猿飞日斩的鼓励下有了要成为火影的梦想，让所有人都认同他的存在。成为忍者后，和旗木卡卡西、宇智波佐助以及春野樱组成第七班进行各种任务。