与其他人种形成的过程一样，蒙古人种的形成是一个既漫长又复杂的过程。

蒙古人种大约起源在东非维多利亚湖沿岸。后来经过几万年分化、迁徙，在地理分布上基本定格为今天的格局。人类学家通过对我国石器时代人骨标本人种问题的考察反映出一个基本的事实，那就是，中国是蒙古人种（黄色人种）的主要发祥地之一。从旧石器时代中期以来，我们的远古祖先就在非洲这块土地上开始了向蒙古人种的发展历程。这一人种的形成、发展和分化的过程基本上是在单一的蒙古人种主干水平上发生的。这种相对来说比较单纯的人种学背景，为阐明东亚、美洲文明几千年来持续稳定的发展奠定了坚实的基础。从新石器时代开始，由于气候逐渐转暖和社会生产力的发展，人类的生存空间不断扩大，生活条件也有了改善，人口的数量急骤增加。因此可以想见，当时各人类群体之间的迁徙、接触和混杂现象一定较之旧石器时代来得更加频繁，这无疑将会大大地促进人种分化的历史进程。在我国地下出土的古人骨研究资料中，新石器时代、青铜时代和早期铁器时代的材料比较丰富。这些人类学资料多半集中在田野考古工作开展的时间较长、遗址分布比较密集的黄河流域、内蒙古长城地带、燕山南北以及长江中下游和部分南方沿海地区。历史上，蒙古利亚人种的种族特点出现的非常早。早在四五十万年前的北京猿人，就是铲型门齿，这是蒙古利亚人种的特有性状。但北京猿人不是现代黄种人的祖先。真正的黄种人在五万年前的中国才出现，典型的是坝人，柳江人。但更出名的是一万八千年前的北京一带的山顶洞人，他具有了大部分现代黄种人的特点。山顶洞人是一种尚未分化的黄种人，他兼具了远东，北方，北极和美洲蒙古人种的特点，甚至正如当时北欧人具有蒙古利亚人种特点一样，他也具有一些北欧白人的特点。有的学者估计，山顶洞人已经和北欧白人在隔绝状态下繁衍了两万年，即大概1000代。这两万年并不是单纯的就地繁衍，而是伴随着大规模的迁徙的。从所谓蒙古人种的祖先从东非向东北亚洲启程那一刻始，蒙古人种的繁衍分化就掐下了秒表。