是的，新医院是由吉林省人民政府和长春市人民政府拨地、卫生部投资基建、日本政府无偿援助价值26亿日元先进设备而共同兴建的，新医院的建成是中日两国人民、两国政府友谊的结晶，医院被命名为“白求恩医科大学第三临床学院(中日联谊医院)”。

2000年6月，吉林大学、白求恩医科大学等5所高校合并组建新吉林大学，医院易名为“吉林大学中日联谊医院”。