重庆工商大学是在我国深化高等教育体制改革，大力实施西部大开发战略和重庆直辖的时代背景下，于2002年经国家教育部批准，由原渝州大学和原重庆商学院合并组建而成，由中央和地方共建，以重庆市政府管理为主。

原渝州大学于1978年经原国家教委批准成立，隶属重庆市，是覆盖理、工、文、经、管、法等多个学科门类的全日制普通高等学校，其前身是西南军政委员会于1952年批准成立的重庆机电工业学校。

1984年教育部批准渝州大学为重庆市市属全日制普通高等学校，1985年获学士学位授予权。重庆商学院于1987年经原国家教委批准正式成立，隶属原商业部，是一所以经济类、管理类专业为主，兼有文、法、工等多学科的财经类全日制普通高等学校，其前身是1962年成立的重庆市财贸干部学校。

1991年获学士学位授予权。

1998年9月，学校划转重庆市，实行中央与地方共建，以重庆市管理为主。