全国大部分省级单位设有考古研究所，主要负责本地区地下文物的发掘保护和研究。

因为可以占据最新的出土资料，所以文物研究水平也非常高。国内最高的考古机构当推中国社会科学院考古研究所。此外还有中国文化遗产研究院（原中国文物研究院）等。各省级研究所不便横向对比，但总体都具有相当高的科研水平。不过，上海地区没有考古研究所，上海的考古工作由上海博物馆考古部负责。类似情况还存在于南京博物馆，福建博物馆，湖北博物馆等处。