南京农业大学的园艺专业学费低可能有以下几个原因：

1. 公立高校：南京农业大学是一所公立高校，相比私立高校，公立高校的学费通常较低。

公立高校的学费由政府拨款和学校自筹资金组成，政府的资助使得学费相对较低。

2. 相关政策支持：南京农业大学园艺专业可能得到了相关政策的支持，在学费政策上可能享受了一定的优惠或补贴。政府可能出台了一些支持农业相关专业的政策，以鼓励更多的学生选择农业和园艺专业。

3. 地区经济水平：学费的高低也与所处地区的经济水平有关。南京农业大学位于南京市，作为中国东部经济发达地区之一，这种地区可能有更多的财政支持和资源投入，从而降低学费。需要注意的是，以上仅是一些可能的原因，具体情况需要参考相关学校和政策的具体规定。