南京财经大学的金融工程专业要优于南京信息工程大学金融工程专业，南财大是省属财经类特色院校，其经济学、管理学是其优势学科，金融工程专业获评省级特色专业；而南信大是以大气科学为特色的双一流大学，虽然综合实力强于南财大，但金融工程不是该校的优势专业，财经类专业的实力没有南财大强。