奥尼尔毕业于路易斯安那州立大学，商业系。

1990年，十八岁的奥尼尔进入了路易斯安那州立大学（LSU）的商业系，而且加入了校篮球代表队。他在LSU的篮球队时，取得了两次NCAA全美南部最佳球员。

1990年12月3日，在对密西西比州立大学的赛事中，他取得了17个盖帽，打破NCAA单场盖帽纪录。奥尼尔在路易斯安那州立大学效力了三个赛季，场均可以拿到21.6分13.5个篮板，并两度被命名为全美最佳球员。但路易斯安那州立大学自从奥尼尔入读以来，都没有打进美国大学篮球冠军赛（NCAA）四强。奥尼尔在读了两年之后离开学校，参加了1992年的NBA选秀。

2000年，奥尼尔拿到了学校的学士学位，并入选了路易斯安那州立大学篮球名人堂。