清华海峡研究院是继深圳、北京、河北、浙江之后，由北京清华大学与地方共建的第五个地方研究院，将充分发挥、利用两岸清华和厦门三方的人才、技术优势，连接和整合海峡两岸产业、金融、科技、教育、文化资源，在信息技术、新能源与新材料、生物医药、生态环境、金融等若干学科领域设立重点实验室，联合研究中心、虚拟研究中心、博士后流动站、技术转移中心、创新创业孵化基地等。