吉尔吉斯斯坦一直财政赤字，是因为该国经济结构单一，主要以农业和矿业为主，缺乏多样化的经济来源，同时政府的税收能力较为薄弱，财政收入不能满足政府支出的需求，导致财政赤字不断。

同时，政府的财政支出过于庞大，包括各类社会保障和基础建设等，这也加剧了财政赤字的问题。