海关是国家行政机关，口岸是一个泛指，不是针对于具体的部门或单位，也不是事业单位。

口岸管理部门有海关、商检、税务、外汇管理局等，口岸服务部门有银行、港务局、场站等，进出口企业、货代、报关行等属于口岸应用单位。地方政府下有口岸办予以协调口岸管理事宜，没有实权。一般大的口岸都会由海关。

口岸是一种泛指，简单说就是进出口货物的集散地和枢纽。其管理部门有海关，商检，税务，外汇管理等部门。包括国家指定的陆路口岸，航空口岸，航运口岸等。海关是根据国家法律（地方性法规）成立管理进出口事物的行政机关，是事业单位。目前我国海关有46个直属海关单位。

口岸是陆地关口，海关是海岸关口，任何一个国家的人和货物都必须通过口岸和海关通过审核才可以进入他国领土上，如果通过非法渠道运输货物进入他国就叫走私被抓住会受到法律处罚，人非法进入他国就是偷渡会被罚款拘留和驱逐出境的。

海关是依据本国（或地区）的法律、行政法规行使进出口监督管理职权的国家行政机关。是一个机构。

口岸原意指由国家指定的对外通商的沿海港口。是一个地方。海关和口岸都是和对外贸易及交流有关。