最主要的区别在于前往时候是跟随团队还是个人前往，公民若跟随旅游团前往是必须办理团队签注，而个人前往就需要办理个人签注，主要根据前往性质来判断办理个人还是团队。
港澳通行证（全称：中华人民共和国往来港澳通行证 ）俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。来港澳前，必须取得内地公安部门签发有关来港澳目的签注（如团队旅游、个人旅游、商务或其他签注等）。
2014年5月19日，公安部宣布在广东试点启用电子往来港澳通行证。从5月20日开始，广东居民可申领和换发内存有数字化的个人资料和指纹信息的电子通行证，使用口岸自助查验通道实现自助通关。中国公安机关出入境管理部门自2014年9月15日起全面启用电子往来港澳通行证（即2014版往来港澳通行证）。大陆居民前往台湾地区定居、探亲或应邀参加经济、科技、文化、教育、学术等活动，向户口所在地的市、县公安机关出入境管理部门提出申请。凭公安出入境管理部门签发的大陆居民往来台湾通行证及有效签注前往。
