北京协和医学院不能算是清华大学，二者是合作关系。

北京协和医学院，与清华大学于2006年起开展联合办学，也可以称为“北京协和医学院—清华大学医学部”。更名后，北京协和医学院仍为独 立法人单位，原隶属关系、人员编制、资产关系和经费管理体制保持不变。