1. 学位分类区别：工学硕士为学术型研究生，工程硕士为工程类专业学位。

2. 生源方面的区别：工学硕士以应届毕业生为主，多数没有实践经验；工程硕士以具有工程实践经验的优秀在职人员为主。

3. 培养侧重点的区别：工学硕士研究生教育以研究和发现自然界客观规律为主，强调理论学习和学术研究；工程硕士专业学位研究生教育侧重于工程应用。