外地车去北京大学第六医院昌平院区，把车停在医院的停车场是最合适的，并且记住医院停车场入口为医院门口西侧，停车费用为按时计费，一小时内10元，24小时最高收费60元。

医院的停车场还挺大的，一般情况下可以找到停车位，同时，也需要注意遵守交通规则，不要随意在医院周边停车，以免影响交通和治安。