甘肃中医药大学的校徽以绿色为主色调，中间部分为一本翻开的书，寓意着中医药与健康的关系。

书本上方有三根阴阳鱼组成的太极图，象征着中医的阴阳平衡理论。周围环绕着甘肃中医药大学的校名和英文缩写。整个校徽寓意着甘肃中医药大学致力于培养具有传统文化底蕴和现代医学知识的中医学人才，为人类的健康事业做出贡献。