没有区别，“北方交通大学”是北京交通大学的曾用名。

北京交通大学1921年参与合并组建交通大学；1923年更名为北京交通大学；1970年恢复使用“北方交通大学”校名；2003年恢复使用“北京交通大学”校名。北京交通大学是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，教育部、交通运输部、北京市人民政府、中国国家铁路集团有限公司共建高校，位列“211工程”、“985工程优势学科创新平台”、“世界一流学科建设高校”。