马来西亚入境通关流程如下：

1. 抵达机场：旅客先要到达马来西亚的机场，如吉隆坡国际机场、槟城国际机场等。

2. 填写入境卡：在登机前，旅客需要填写入境卡，其中包括个人信息、行程路线等基本信息。

3. 通关：在机场抵达后，旅客需要前往海关办理通关手续。旅客需要提供入境卡、有效护照以及其他相关证件，海关官员会对这些文件进行检查，包括签证、机票、旅行保险以及旅行资金证明等。

4. 安全检查：旅客需要通过安全检查，包括随身携带物品的安检。

5. 领取行李：经过安全检查后，旅客可以前往行李领取处领取行李。

6. 出入境办理：如果旅客需要前往其他地方，如酒店等，则需要搭乘机场大巴、出租车等交通工具前往目的地；如果直接前往马来西亚其他城市，则需要到达对应的交通枢纽，如吉隆坡或槟城，从那里进行中转或者再次通关出境再入境。