清华大学医学部，前身清华大学医学院成立于2001年10月25日，首任院长由中国著名医学科学家、两院院士吴阶平教授担任。
后与北京协和医学院合作办学，有时使用“北京协和医学院-清华大学医学部”的名称。清华大学医学部，2006年9月根据教育部、卫生部签署的清华大学与中国协和医科大学紧密合作办学协议，以及两校关于落实两部协议的实施意见，“中国协和医科大学”加挂“北京协和医学院—清华大学医学部”牌子。清华大学医学部，雄厚的基础学科综合优势和优良的学术氛围，与协和在医学领域中强大的科学研究和临床医学实力，将优势互补，共同发展。
