中科院（中国科学院）与清华大学北大（北京大学）的区别主要表现在以下几个方面：

1. 成立与定位：中科院是中国最高的自然科学研究机构，成立于1949年，致力于开展基础研究和战略科技研究；清华大学和北京大学则是中国两所最顶尖的综合性大学之一，清华大学以工工为主，北京大学以文理为主。

2. 层次与规模：中科院包括二处中科院所和数量众多的科研院所，涵盖了多个学科领域，其下属机构数量庞大，并在国内外享有较高声誉；清华大学和北京大学则是中国规模最大、层次最高的综合性大学之一，两校的学科涵盖面广，并在国内外都拥有较高的学术地位和声誉。

3. 办学层次：中科院下设研究生院，主要培养研究生和博士生；清华大学和北京大学则是综合性大学，除研究生之外还招收本科生，并提供本科教育。

4. 教育与科研重心：中科院的主要任务是开展科学研究，为国家决策提供科技支持，培养高水平科研人才；清华大学和北京大学不仅注重科学研究，也重视教育和人才培养，其本科教育和研究生教育在国内外都享有较高声誉。总的来说，中科院是中国最高的科研机构，以研究为主导，清华大学和北京大学则是综合性大学，注重教育和科研，并且在多个学科领域都有卓越的表现。