1994年，原四川大学和原成都科技大学合并为“四川联合大学”。

1998年，更名为四川大学，党和国家领导人就两校合并为学校题词并寄予深切厚望。四川联合大学的历史仅维持了四年，被誉为川大历史上最为黑暗的四年。联合大学听起来像是专科院校一样，如北京联合大学，最初起四川联合大学估计是希望沾一点“西南联大”的光。当时北大、清华和南开被迫迁移，先是在长沙建立长沙临时大学，后来西迁至云南昆明，更名西南联合大学，创造了中国高等教育史上最为轰动的一段历史。

1994年与成都科技大学合并，出于各种原因，其中很大一部分原因估计是在于两校如果以其中某一个命名会降低原来学校的存在性。为了更好地展开合作，搁置两校合并后可能潜在的冲突和矛盾，干脆重新确定一个新的名字。于是，四川联合大学的名字也就应运而生。

1998年之所以改过来是因为两家合并之后，发现这个名字在很大程度上阻碍了新学校的发展。首先就表现在学校的知名度和美誉度上，主要就是生源不行，在当时很多考生的眼里”XX联合大学“一听就是一个专科院校，另外也由于四川本身就地处西部，本来的生源质量就很难和东部沿海和中部地区的高等院校相比。合并后的原两校的主要领导，出于学校的长远发展，通过各方面的努力建议党中央领导允许学校更名。于是，才有了今天的再次更名为四川大学。