物流工程专业所学的主要课程有：科学社会主义理论、自然辩证法、外国语、高等工程数学、数值计算、概率论与数理统计、运筹学、统计学等、计算机应用、管理学概论、工程经济学、交通运输工程，规划理论，计划与调度技术、物流设施规划与设计、现代物流与供应链管理、物流装备与设施技术、物流系统建模与仿真、物流系统运作管理、项目管理、国际物流管理、物流运输管理等。