总体可分为三类：军校招生时一般分指挥类专业和非指挥类专业。
除了这两类专业外，还有一类专业———“合训分流”专业。
1. 指挥类专业指挥类专业有明确的培养目标，主要是为各军兵种培养军事指挥管理人才。军事指挥军官主要包括排长、连长、营长，海军部队的部门长、舰(艇)长等；政治指挥官主要包括连(分)队政治指导员、营政治教导员、团(大队)政委、舰(艇)教导员或政委等；后勤指挥军官；各种日常和战场保障勤务分队的分队长和指挥军官，在司令部、政治部、后勤部、装备部等机关，也有相当一部分指挥军官的岗位，主要包括各类军事参谋、政治干事、后勤助理员等。试举海军大连舰艇学院学员为例。考生被录取后，经过4年或5年的培训将成为海军初级指挥军官。学员毕业后将分配到海军舰艇部队的初级指挥岗位，第一任职通常为舰艇部门长或分队长。当然，还有一部分学员准备攻读硕士和博士学位，研究生毕业后也将根据其专业分配到相应的指挥岗位。根据海军部队编制构成及其干部成长规格，指挥类军官按初、中、高三级，实行技术指挥、兵种战术指挥、合同战术指挥、战役指挥四层次培训。也就是说，如果干得出色，将有机会到海军兵种指挥学院(原海军广州舰艇学院)学习兵种战术指挥，然后成为一名副舰长或舰长。进入海军中级指挥岗位前，必须到南京海军指挥学院深造，学习合同战术指挥。海军高级指挥军官都要到解放军最高军事学府——中国人民解放军国防大学，学习战役指挥。
2. 非指挥类专业专业技术院校以及综合院校的非指挥类专业，担负着为部队、军队科研单位、军校培养专业技术人才的任务。其毕业学员主要到部队的各个专业技术岗位任职。根据工作岗位的具体需要，一般评任专业技术职务。军队高等专业技术院校，均有国内先进的教学和技术设备，有很强的师资力量，既能培养从事实际技术工作的操作人员，又能培养高技术人才。如国防科技大学，该校的非指挥类专业为科学与工程技术专业，该专业又包括了空间工程和飞行器系统与工程两个专业方向。
3. “合训分流”专业“合训分流”的全称是“学历教育合训、专业训练分流”。这是1999年全军院校编制体制调整后开始的新的初级指挥专业人才培养模式。“合训分流”的培养目标是：培养懂技术、会管理、能指挥的复合型初级指挥军官。由于这种培养模式还属于一种新的尝试，包括模式、政策、待遇、就业前景等在内，还在不断地完善中。承担“合训”任务的军校还局限于几所综合大学和部分基础较好的综合院校。
