环境工程专硕学校主要分布在中国的一些综合性高校和工科院校中。

其中，清华大学、北京大学、同济大学、华南理工大学、哈尔滨工业大学、东南大学、浙江大学、南京大学、华东师范大学等院校都设有环境工程专硕学位。这些学校在环境工程领域具有较高的学术声誉和教学水平，拥有一流的师资团队和先进的实验设备，为学生提供了良好的学习和研究环境，培养了大批优秀的环境工程专业人才。